Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms