Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2bQ6P1G2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2bQ6P1G2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2bQ6P1G2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2bQ6P1G2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2bQ6P1G2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm2bQ6P1G2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdm2bQ6P1G2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Kdm2bQ6P1G2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms