Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Slx4Q6P1D7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Slx4Q6P1D7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slx4Q6P1D7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slx4Q6P1D7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slx4Q6P1D7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Slx4Q6P1D7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms