Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms