Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1l1Q6NZP2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms