Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rprd2Q6NXI6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms