Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms