Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fndc3bQ6NWW9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms