Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf8Q6DID3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf8Q6DID3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms