Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Smarca2Q6DIC0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Smarca2Q6DIC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms