Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prex1Q69ZK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prex1Q69ZK0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms