Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrcc1Q69ZB0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms