Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn4Q69Z26 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cntn4Q69Z26 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms