Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sptbn2Q68FG2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms