Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rapgefl1Q68EF8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rapgefl1Q68EF8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgefl1Q68EF8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms