Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms