Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q66JV7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q66JV7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q66JV7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q66JV7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q66JV7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q66JV7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q66JV7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q66JV7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q66JV7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q66JV7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q66JV7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q66JV7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q66JV7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q66JV7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q66JV7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q66JV7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms