Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc8eQ66JT1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms