Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2abQ64522 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2abQ64522 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms