Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm4sf1Q64302 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm4sf1Q64302 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms