Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms