Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfe3Q64092 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfe3Q64092 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms