Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps72Q62481 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps72Q62481 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps72Q62481 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms