Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp4Q62445 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms