Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf6Q62311 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf6Q62311 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms