Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18Q62280 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms