Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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