Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sin3bQ62141 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sin3bQ62141 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms