Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phox2aQ62066 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms