Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LbpQ61805 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LbpQ61805 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LbpQ61805 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbpQ61805 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms