Protein–RNA interactions for Protein: Q61575

Foxn1, Forkhead box protein N1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn1Q61575 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn1Q61575 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn1Q61575 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms