Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AlcamQ61490 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlcamQ61490 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms