Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccna1Q61456 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms