Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd53Q61451 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd53Q61451 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms