Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde3bQ61409 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde3bQ61409 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde3bQ61409 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms