Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tfap2bQ61313 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2bQ61313 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms