Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AcanQ61282 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms