Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms