Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc6Q61143 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms