Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd3Q61060 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd3Q61060 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms