Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wbp4Q61048 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms