Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep250Q60952 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep250Q60952 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms