Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf8Q60846 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf8Q60846 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms