Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r1bQ60829 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms