Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stxbp3Q60770 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms