Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atf3Q60765 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf3Q60765 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf3Q60765 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms