Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samhd1Q60710 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samhd1Q60710 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms