Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd5Q5VCS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms