Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms