Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mks1Q5SW45 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms